樹木在生長過程中，由于大環境不同、背陰向陽、高低疏密都有差異，使得不同地域的同一樹種之間有所差異，即便在同一片樹林中的樹木，都可能呈現出不同的色澤及紋理。

實木木門有些是用樹根做成的，有些是用樹梢做成的，靠近樹根的地方顏色深，靠近樹梢的地方顏色淺。

木門木材開板法不同，有些是徑切而成，有些是弦切而成，加工出來后木門紋理不一致，不同木紋的兩塊木門視覺上必然會出現色差。

一般靠近窗戶的木門顏色要明顯比陰暗位置的木門顏色要亮，這個主要受陽光照射影響造成的視覺上木門色差。

一般來說，復合木門本身出現色差的情況很少，而實木木門的色差不可避免。這是因為，實木木門的色差是天然的屬性所決定的。木頭是多孔性材料，不同部分材質疏密不同，各部位吸收光線和油漆的程度也不一樣，所以有時同一塊木門兩邊的顏色會出現深淺和不同紋理。

為避免由于實木木門色差過大，給居室的整體美觀造成影響，消費者可以通過要求廠家發同一批次的木門產品來控制自家木門的色差問題。木門有稍微的色差是正常的，木門色差值是在許可范圍內的，一般來說，不超過5%的色差是算合理的。